В начале Великой Отечественной войны большинство санитарных работников ушло на фронт, принимая активное участие в боевых действиях в качестве санинструкторов и полевых эпидемиологов. Их работа спасла жизни десятков тысяч людей, обеспечивая санитарное благополучие в условиях войны. Оставшиеся сотрудники санслужбы Волгоградской (в то время Сталинградской) области трудились в невыносимых условиях.

Серьёзную нагрузку взяло на себя Военно-санитарное управление юго-восточного фронта, сформированное 9 августа 1942 года. Основной задачей этого управления стало медико-санитарное обслуживание войск, раненых и оставшегося гражданского населения.

Эпидемиологическая обстановка в Сталинграде была крайне угрожающей. Летом 1942 года среди заключённых исправительных колоний было зарегистрировано 30 случаев холеры. Поставленный санитарный щит предотвратил дальнейшее распространение заболевания. Во время вспышки холеры в подразделении немецких войск, для недопущения ее распространения среди наших солдат, в город вылетела Зинаида Виссарионовна Ермольева, выдающий ученый-микробиолог, которая организовала получение холерного бактериофага и провела бактериофагирование солдат в самые кротчайшие сроки, ежедневно – до 50 тысяч солдат. Этот исторический шаг позволил остановить распространение страшной инфекции.

С лета 1942 года по 2 февраля 1943 года пригород и сам Сталинград стали полем одной из самых ожесточённых битв в истории. Санитарное состояние города было критическим, с постоянной угрозой вспышек брюшного тифа, туляремии и кишечных инфекций. Профилактическим мероприятиям придавалось первостепенное значение.

После Сталинградской битвы город оставался в руинах: разрушенные здания, покорёженная военная техника создавали ужасающий пейзаж. В 1943 году в Сталинграде зафиксированы вспышки детских инфекций и сыпного тифа. На детское население обрушились рахит, дизентерия, дифтерия, корь и коклюш, а малярия стала настоящим бедствием для жителей города.

Ликвидация санитарных и экономических последствий войны была невероятно сложной задачей. Восстановление города началось сразу после окончательной стабилизации фронта. Вернувшиеся после войны сотрудники, принимавшие участие в боевых действиях, вновь стали трудиться в санэпидслужбе области, продолжая свою важную миссию по охране здоровья населения.